人类文明进入动乱的时代，地球笼罩在战火之下，各大主要城市相继沦陷，人类四散而逃，血流成河。虽然星野铁郎（野沢雅子 配音）破坏了机械化星球，但是机器人与人类的战争仍在继续，并且人类已经到了生死存亡的危急时刻。正值紧要关头，铁郎得到来自梅蒂尔（池田昌子 配音）的信息，要他重新搭乘银河铁道999号。在一众战友的帮助下，铁郎穿过一道道火线，经过几番周折，终于登上了久违的银河铁道999号，重新开始了一段漫长、孤独而又充满惊险的宇宙旅程…… 本片为《银河铁道999》第二部剧场版动画。
演员：梶原岳人 小林裕介 中井和哉 铃村健一 上条沙惠子 市道真央 悠木碧 八代拓 阪口大助 楠大典 兴津和幸 日野聪 宝龟克寿 土师孝也 鸟海浩辅 小西克幸 长岛雄一 小野大辅 古川慎 坂田将吾 Lynn 河西健吾 大原沙耶香 金元寿子 宫野真守 前野智昭 赤尾光 坂本真绫 内山夕实 钉宫理惠 松冈祯丞 乃村健次 千叶进步 岛袋美由利 大久保瑠美 小林亲弘 青山穰 安元洋贵 日笠阳子 关智一 津田健次郎 樱井孝宏 朝井彩加 小野友树 伊藤健太郎 速水奖
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